Parte de la fauna del arrecife de coral tienen su actividad durante el periodo nocturno, en particular los invertebrados. Mientras que durante el día la abundante flora de algas realizara su función fotosintética absorbiendo la luz solar y transformándola en alimento de los cardúmenes de peces que se alimentan de las algas, del plancton o detritus.
En los arrecifes de coral del Mar Caribe algunas especies de coral son más abundantes que otras por lo que contribuyen en mayor o menor grado a la estructura del arrecife. Las especies más comunes son el Cacho de Venado (Acropora cervicornis), Cuerno de Alce (Acropora palmata) y el Coral Cerebro (Faviidae spp).
En los arrecifes de coral hay una infinidad de formas de vida entre las más visibles están las gorgonia (Gorgonia mariae), algas (Padina jamaicensis), esponjas (Aplysina fistularis).
Gastropodos (Cyphoma gibbosum), Nudibranquios (Aplysia dactylomela) y cefalopodos como el pulpo ( ........).
Anemonas de Mar ( Condylactis gigantea), Crustaceos del Coral (Carpilius corrallinus), Cangrejo Hermitaño (Calcinus tibicen).
Erizo de Espinas Largas (Diadema antillarum), Pepino de Mar (Isostichopus badionotus), Tunicado Campana Azul (Clavelina puerto-secensis).
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